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苹果双卡手机的短信区分副卡的方法如下。
1、收发短信时，在短信编辑界面的上方选择主副卡，选择正确的卡后，输入短信内容并发送即可，接收短信时，无需进行任何操作，只要查看短信发送方号码即可知道是接收的是哪张卡的短信。
2、在手机的设置功能中，找到蜂窝数据选项，点击进入后可以看到两张卡的设置选项，在此界面可以选择默认使用哪张卡进行数据连接和拨打电话，对于短信来说，可以在信息应用的设置中选择默认使用哪张卡进行发送和接收短信，当收到短信时，系统会明确标注是来自哪张卡的短信。
仅供参考，建议咨询苹果官方客服或前往线下门店了解更详细的信息。